1、協助辦領導對各處工作進行綜合協調，負責防辦行政及日常事務，包括值班管理、會議計劃、行政后勤等工作。

2、負責公文、機要、檔案的管理和保密工作。

3、承辦防辦人事、培訓工作，組織出國計劃申報。

4、負責綜合性重要會議的組織籌備工作（國家防總會議、全國防汛抗旱工作會議等重大會議辦內成立專門籌備小組）。

5、負責工作總結、階段性汛情旱情災情等綜合性材料的起草。組織對人大建議、政協提案及群眾來信等的處理及答復。

6、組織擬訂防汛抗旱法律法規、規章制度并監督實施。歸口管理防汛抗旱綜合規劃、防汛抗旱預案。對防汛抗旱重大問題進行調研。

7、負責國家防汛抗旱總指揮部各成員單位的總體協調工作。組織國家防總防汛抗旱汛前檢查。

8、負責地方防汛抗旱行政首長責任制公布、督查等工作，組織指導各級防辦能力建設，組織防汛抗旱業務培訓工作。

9、歸口管理水庫防洪綜合業務工作。

10、負責防辦業務經費預算申報、執行監督及固定資產管理等工作。

11、承擔水利部反恐怖領導小組辦公室日常工作，承擔水利部扶貧領導小組、水利部安全生產領導小組安排的有關工作。

12、承辦辦領導交辦的其他事項。